C3bจะจับกับ soluble immune complexes ในกระแสเลือด , เม็ดเลือดแดงซึ่งมี CR1จะจับกับ immune complexes ที่มี C3bคลุมอยู่ และนำcomplexesนี้ไปสู่ตับและม้าม ที่นี่ immune complexes จะแยกจากเม็ดเลือดแดงและถูกจับกินโดย phagocytic cells ซึ่งกระบวนการนี้จะเป็นการป้องกันการเกิดการเกาะตัวบนเนื้อเยื่อของ immune complexes
ความสำคัญของระบบคอมพลีเมนท์ในการกำจัด immune complexesออกไปจากระบบไหลเวียนเลือด จะพบได้ในผู้ป่วย autoimmune disease: SLE ซึ่งพบว่ามีการพร่องของคอมพลีเมนท์คือ C1, C2, C4, CR1 ทำให้ C3bต่ำ เป็นผลให้มี immune complexes ฝังตัวอยู่ตามเนื้อเยื่อและเกิดการทำลายเนื้อเยื่อตามมา