| PCR ถูกนำมาใช้ในสาขาโรคติดเชื้อ ในหลายๆ ด้านด้วยกัน แบ่งออกเป็นหมวดหมู่ได้เป็น |
 1. ใช้ในการวินิจฉัยโรคติดเชื้อ |
| 2. quantitative PCR ในการติดตามผลการรักษา |
| 3. quantitative PCR ในการวินิจฉัยโรค |
| 4. ใช้ในการตรวจกรองโรคติดเชื้อที่ติดต่อจากการรับเลือดและผลิตภัณฑ์ของเลือด |
| 5. ใช้ในการตรวจหาเชื้อดื้อยา |
| 6. ใช้ในการศึกษาระบาดวิทยาของโรค |
| quantitative PCR ในการติดตามผลการรักษา |
| โดยดูจากจำนวนของเชื้อในเลือดที่ลดลง ได้แก่การทำ viral load assay ของ hepatitis B virus, hepatitis C virus, และ HIV หลังการให้ยาต้านไวรัส |
