| PCR ถูกนำมาใช้ในสาขาโรคติดเชื้อ ในหลายๆ ด้านด้วยกัน แบ่งออกเป็นหมวดหมู่ได้เป็น |
 1. ใช้ในการวินิจฉัยโรคติดเชื้อ |
| 2. quantitative PCR ในการติดตามผลการรักษา |
| 3. quantitative PCR ในการวินิจฉัยโรค |
| 4. ใช้ในการตรวจกรองโรคติดเชื้อที่ติดต่อจากการรับเลือดและผลิตภัณฑ์ของเลือด |
| 5. ใช้ในการตรวจหาเชื้อดื้อยา |
| 6. ใช้ในการศึกษาระบาดวิทยาของโรค |
| ใช้ในการตรวจหาเชื้อดื้อยา |
| วิธีการตรวจหาเชื้อดื้อยาทางห้องปฏิบัติการ ที่นิยมทำกันในปัจจุบัน คือ การตรวจหาการแสดงออกของยีนดื้อยา (ตรวจ phenotype) เช่น การทำ disc sensitivity test หรือ การหา MIC แต่การตรวจหาเชื้อดื้อยาบางชนิด เช่น methicillin-resistant Staph aureus (MRSA) อาจทำได้ไวและแม่นยำกว่า จากการตรวจหายีน Mec A ด้วยวิธีทางชีวโมเลกุล เช่น DNA probe หรือ PCR เพราะยีนนี้ ไม่ปรากฎใน methicillin-sensitive Staph aureus วิธีการตรวจหายีนหรือการกลายพันธุ์ของยีน (mutation) ยังนำมาใช้ตรวจหาเชื้อดื้อยาอีกหลายชนิด เช่น Enterococcus ที่ดื้อต่อ vancomycin เชื้อแกรมบวกและแกรมลบที่ดื้อต่อ quinolone เชื้อวัณโรคที่ดื้อต่อ rifampicin, INH, ethambutol, และ streptomycin ตลอดจนถึงการดื้อยาของไวรัสบางตัว เช่น ไวรัสกลุ่ม herpes ที่ดื้อต่อ acyclovir หรือ foscarnet เชื้อ CMV ที่ดื้อต่อ ganciclovir หรือเชื้อไวรัสเอดส์ ที่ดื้อต่อ nucleoside reverse transcriptase inhibitor หรือ protease inhibitor เป็นต้น |
